在一个风景如画的英国村庄里，博物学家查尔斯达尔文(保罗贝坦尼保罗贝坦尼饰)和他的妻子及女儿过着平静的生活。他十岁的女儿安妮对世界充满好奇，达尔文教给了她很多自然科学知识，包括他的进化论。然而，当世人相信上帝是创造者时，女儿口中的进化论无疑是危险的，以至于她受到了导师的惩罚，甚至连达尔文深爱的妻子艾玛(詹妮弗林恩康纳利詹妮弗康纳利饰)也无法认同他的想法和研究。达尔文更加痛苦。不久后，小安妮因病早逝，支撑他完成理论的唯一力量源泉也随之消退。整理《物种起源》手稿的工作变得像逆行的荆棘，很困难.这部电影改编自达尔文的第三个曾孙兰德尔凯恩斯的传记小说《安妮的盒子》。